der VIA CPU ist um einiges langsamer, unterstützt einige Befehlssätze nicht, die der Intel Atom unterstützt, hat nen geringeren L2-Cache und verbraucht, aufgrund seiner Bauweise, mehr Strom.
Der VIA CPU hat auch schon mehrere Jahre auf dem Buckel.

Ich persönlich würde zum Intel Atom greifen, wenn ich in der Wahl stehen würde.